Nam sinh cao trung năm nhất Junta Shiraishi là một nhân vật không gây được sự chú ý trước đám đông ngay cả khi có bạn bè mình đứng bên cạnh. Nhưng người bạn cùng lớp của anh, "cô gái đẹp đến cấp độ nữ anh hùng" Kubo luôn để ý đến và cố tình chọc ghẹo cậu.
In her Junior High years, the pitcher Yomi Takeda was not able to get very far in a cross-school baseball tournament. Since the catcher on her team wasnt at her level, she couldnt use her signature move, the "Magic Throw," and eventually regretted not being able to use it.
Trong những hoạt động ngầm nguy hiểm của thành phố Academy là linh lực gia cấp 5 Accelerator. Anh có thể tiêu diệt bất cứ ai nhờ năng lực của mình, năng lực này cho phép anh tạo ra một trường mỏng của mục tiêu xung quanh anh và chi phối véc tơ của bất cứ thứ gì anh chạm vào. Suốt cuộc đời của Accelerator, anh luôn là đối tượng bị tấn công, do đó, anh mất niềm tin vào con người và chỉ tin vào sức mạnh.
Phần chính của cốt truyện diễn ra tại một trường trung học ở Nhật Bản. Nhân vật Kyousuke từng nhận xét rằng "thế giới này có một bí mật", Kengo và Masato cũng để ý đến điều đó. Các nhân vật sống trong một ký túc xá nam và nữ được xây tiếp giáp với khuôn viên trường.
Narue một nữ sinh đáng yêu và có một bí mật là cô ấy là một người ngoài hành tinh với sức mạnh ngoài sức tưởng tượng và câu chuyện ra sao